Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
F9P00740 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
F9P00740 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F9P00740 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F9P00740 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F9P00740 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F9P00740 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F9P00740 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
F9P00740 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F9P00740 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F9P00740 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F9P00740 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
F9P00740 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F9P00740 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
F9P00740 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
F9P00740 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
F9P00740 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
F9P00740 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
F9P00740 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F9P00740 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F9P00740 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F9P00740 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F9P00740 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F9P00740 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms