Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR5O75473 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGR5O75473 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGR5O75473 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGR5O75473 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGR5O75473 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGR5O75473 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGR5O75473 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGR5O75473 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGR5O75473 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGR5O75473 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGR5O75473 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGR5O75473 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGR5O75473 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGR5O75473 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGR5O75473 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGR5O75473 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGR5O75473 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LGR5O75473 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGR5O75473 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LGR5O75473 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR5O75473 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR5O75473 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR5O75473 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR5O75473 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR5O75473 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR5O75473 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR5O75473 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR5O75473 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR5O75473 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR5O75473 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR5O75473 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR5O75473 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR5O75473 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR5O75473 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR5O75473 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR5O75473 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR5O75473 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR5O75473 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR5O75473 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR5O75473 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms