Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP2O75323 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms