Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3BO75182 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms