Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms