Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSCO60682 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSCO60682 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSCO60682 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSCO60682 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSCO60682 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSCO60682 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MSCO60682 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSCO60682 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSCO60682 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSCO60682 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSCO60682 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSCO60682 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSCO60682 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSCO60682 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSCO60682 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSCO60682 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSCO60682 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSCO60682 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSCO60682 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSCO60682 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSCO60682 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSCO60682 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSCO60682 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSCO60682 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSCO60682 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MSCO60682 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSCO60682 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSCO60682 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSCO60682 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSCO60682 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSCO60682 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSCO60682 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MSCO60682 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSCO60682 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSCO60682 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSCO60682 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSCO60682 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSCO60682 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSCO60682 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSCO60682 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSCO60682 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSCO60682 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSCO60682 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSCO60682 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSCO60682 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSCO60682 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSCO60682 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSCO60682 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MSCO60682 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSCO60682 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSCO60682 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSCO60682 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSCO60682 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSCO60682 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSCO60682 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MSCO60682 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MSCO60682 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MSCO60682 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MSCO60682 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MSCO60682 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MSCO60682 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSCO60682 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSCO60682 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MSCO60682 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MSCO60682 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSCO60682 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MSCO60682 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSCO60682 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSCO60682 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSCO60682 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSCO60682 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSCO60682 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSCO60682 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSCO60682 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSCO60682 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSCO60682 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSCO60682 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSCO60682 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSCO60682 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSCO60682 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSCO60682 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSCO60682 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSCO60682 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSCO60682 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSCO60682 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSCO60682 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSCO60682 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSCO60682 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSCO60682 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSCO60682 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSCO60682 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSCO60682 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSCO60682 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSCO60682 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSCO60682 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSCO60682 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSCO60682 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSCO60682 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms