Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SIPA1L1O43166 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIPA1L1O43166 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms