Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBTB39O15060 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBTB39O15060 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms