Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SETD1AO15047 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD1AO15047 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms