Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFIT3O14879 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIT3O14879 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIT3O14879 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIT3O14879 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIT3O14879 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIT3O14879 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIT3O14879 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIT3O14879 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIT3O14879 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIT3O14879 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIT3O14879 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIT3O14879 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIT3O14879 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFIT3O14879 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFIT3O14879 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms