Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
J3KR12 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
J3KR12 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
J3KR12 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3KR12 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3KR12 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3KR12 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
J3KR12 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms