Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
WASHC1A8K0Z3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms