Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3P2A8K0S8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms