Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85CA6NKD9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms