Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23AA6NH52 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23AA6NH52 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms