Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A0D9SFI3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A0D9SFI3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A0D9SFI3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A0D9SFI3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A0D9SFI3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms