Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRG3Q9Y2Y8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms