Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1AQ9Y241 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms