Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOD1Q9Y239 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms