Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG5Q9UPR3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms