Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD4Q9ULV1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD4Q9ULV1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms