Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms