Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC9Q9UKV0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms