Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP3Q9UKI2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP3Q9UKI2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP3Q9UKI2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP3Q9UKI2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP3Q9UKI2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP3Q9UKI2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP3Q9UKI2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP3Q9UKI2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP3Q9UKI2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP3Q9UKI2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP3Q9UKI2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms