Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MRTO4Q9UKD2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms