Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL4Q9UJQ4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms