Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA1Q9UIW2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms