Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCN11AQ9UI33 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms