Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLKQ9UBT6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
POLKQ9UBT6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms