Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCMF1Q9P0J7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCMF1Q9P0J7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCMF1Q9P0J7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCMF1Q9P0J7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCMF1Q9P0J7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCMF1Q9P0J7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCMF1Q9P0J7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms