Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA3Q9NZ52 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA3Q9NZ52 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms