Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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RRN3Q9NYV6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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RRN3Q9NYV6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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RRN3Q9NYV6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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RRN3Q9NYV6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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RRN3Q9NYV6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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RRN3Q9NYV6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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RRN3Q9NYV6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRN3Q9NYV6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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