Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms