Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDND1Q9NY35 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms