Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CMTM6Q9NX76 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CMTM6Q9NX76 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms