Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
PDS5BQ9NTI5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PDS5BQ9NTI5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PDS5BQ9NTI5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms