Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TULP4Q9NRJ4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP4Q9NRJ4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms