Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST12Q9NRB3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms