Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms