Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ZCCHC17Q9NP64 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC17Q9NP64 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms