Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRMS1Q9HCU9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms