Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
UPF2Q9HAU5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF2Q9HAU5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms