Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP3Q9H6T3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms