Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms