Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC86Q9H6F5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms