Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF41Q9H4P4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF41Q9H4P4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms