Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZCCHC2Q9C0B9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC2Q9C0B9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms