Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TREX2Q9BQ50 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms