Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUSP9Q99956 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP9Q99956 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms