Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms